设为首页|加入收藏

研究成果

Analytical Chemistry:基于熵驱动的链取代反应和荧光RNA适配体实现微小RNA的体内成像

发布:   时间:2024-05-12 19:26:17  浏览:

精准识别肿瘤诊断和预后的密切相关的生物标志物,如蛋白质和RNA,对肿瘤及早诊断和治疗具有重要作用。MicroRNA(miRNA)被是肿瘤早期诊断和治疗的有效生物标志物,如何建立稳定、高效且灵敏度高的miRNA成像方法,保证结果的可靠性和一致性,是制约 miRNA 成为早期诊断临床应用的一个关键环节。RNA荧光适配体是一段能够特异性地结合小分子荧光团,并诱导和增强其发光的RNA序列。RNA荧光适配体较荧光蛋白更易于编辑,具有信噪比高、细胞毒性低、特异性强以及光稳定性好等优势,为胞外和活细胞内功能性物质的可视化研究提供了新的强有力工具。

近期,beat365正版唯一官方网站李长明教授,郭春显教授,谷雨副教授课题组报道了一种基于熵驱动的链取代反应结合荧光RNA适配体技术,成功实现了体内miRNA高灵敏度成像。MiRNA作为靶分子,引发熵驱动的链取代反应,从而释放大量的Corn适配体并点亮DFHO的荧光。该方法不需要结构复杂的tRNA支架,即可高效的自组装成光稳定性好的荧光结构,成功实现了活细胞和体内内源性miRNA分子的高选择性成像。相关成果以“In Vivo Imaging MicroRNA with Bright Fluorescent RNA Aptamer through Target-Mediated Entropy-Driven Toehold Exchange”为题发表在国际化学权威杂志Analytical Chemistry上(DOI: 10.1021/acs.analchem.4c00510)。该论文的通讯作者为beat365正版唯一官方网站李长明教授,郭春显教授,谷雨副教授和2022级研究生白瑞为共同第一作者。

研究的主要内容

具体成像原理如图一所示,该体系由两部分组成:一个单链(S1)和由两个DNA单链S2、S3和一个Corn适配体反应生成的底物(S)的三链结构。其中,S3与Corn适配体和S2部分互补,因此S具有三个不稳定的立足点,以诱导链置换反应进行。在没有目标物的情况下,S1无法与S反应,链取代反应无法进行,但当加入目标miRNA后, 底物S中的S2链首先与miRNA之间的发生链取代反应,形成S3、Corn和T的不稳定三链结中间体(I1),并暴露含有4个核苷酸单链结构(5'-AACT-3')的尾链。这种亚稳结构的中间体可继续和S1发生链取代反应,释放RNA适配体Corn和目标RNA。同时,释放的目标RNA会触发另一个熵驱动的链取代反应,从而释放更多的Corn适配体。该适配体可形成头对头的G-四链体二聚体结构,结合并激活DFHO的荧光,在活细胞内(图二,图三)和体内(图四)实现了不同丰度miRNA的精准成像。

图一:基于熵驱动的链取代反应和荧光RNA适配体实现微小RNA的体内成像原理

图二:(A)细胞内miR-125b成像示意图。(B)用DFHO转录S和S1在PC-3细胞中共聚焦成像细胞内miR-125b。对照细胞仅用DFHO孵育,所有比例尺对应为25 μm。(C)用Leica 3D 成像获得的PC-3细胞用DFHO转录S和S1的3D合并图像的平面和截面图。(D)荧光信号的统计直方图。(E)用EDTE-DFHO(黄色)、DFHO(绿色)和对照细胞(紫色)转染PC-3细胞的流式细胞术分析。

图三: 使用EDTE-DFHO对不同细胞中miR-125b表达水平的共聚焦图像图及相关荧光统计直方图。所有比例尺均为25 μm

图四:(A) Hela细胞成瘤的小鼠体内miRNA-21成像示意图。(B)瘤周注射探针和DFHO后,不同时间点的小鼠miR-21荧光成像:a. 对照组;b (1.3 cm) 和c (2.0 cm) 为不同肿瘤体积的小鼠。(C)图6B中肿瘤部位的荧光强度。(D)转染探针24h后小鼠肿瘤的染色组织学切片。标尺:50µm。

本研究报告了一种通过熵驱动的链取代反应对 miRNA 进行高灵敏度和选择性成像的通用性策略,其中 miRNA 充当催化链来启动熵驱动的链取代反应,并不断反馈循环释放适配体Corn,从而点亮 DFHO 的荧光,极大的增强了荧光信号的强度。该体系选择性好,避免了荧光染料的预修饰和荧光蛋白的长时间表达,仅需要简单的核酸结构,而不是茎环,tRNA折叠等复杂的二级结构,即可实现目标物的荧光信号放大,并成功应用于细胞和体内成像。与报道的基于Corn的“一对一”成像模型相比,该方法对相同miRNA细胞内成像的信噪比显著提高了4.6倍。此外,通过更改探针的识别单元,可实现包括miRNA-125b和miRNA-21在内的不同miRNA的高灵敏度成像,具有普适性,为研究肿瘤相关 miRNA 的功能和相互作用提供了潜在的工具,在临床诊断和预后中具有指导作用。